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SEMINAIRE DU DEPARTEMENT “ Récepteurs dans leur contexte
membranaire ”
*Lundi 23 mai 2005 à 11 heures
Dr Didier ROGNAN
Bio informatique du Médicament, UMR 7081, ILLKIRCH
Criblage virtuel à haut débit de chimiothèques et de
ciblothèques : Application à la famille des récepteurs couplés aux
protéines G
Les récepteurs couplés aux Protéines G (RCPGs) constituent la
principale famille de cibles d'intérêt thérapeutique. La structure
cristallographique de la rhodopsine bovine [1] offre la possibilité
de construire par homologie une structure tridimensionnelle de RCPG
dont la validité peut être évaluée expérimentalement. Au cours des
deux dernières années, nous avons mis au point un programme
générique de modélisation à haut débit des RCPGs du génome humain
[2] constituant ainsi une ciblothèque de 372 récepteurs non
olfactifs [3].
Ces modèles peuvent être utilisés afin de définir l'architecture
fonctionnelle de sites de liaisons [4-7], d' identifier de nouveaux
ligands par criblage virtuel [8], ou de comparer les sites de
liaisons transmembranaires par criblage virtuel de la ciblothèque
[9]. La combinaison du criblage virtuel de chimiothèques et de
ciblothèques offre une nouvelle approche chémogénomique à la
conception de candidats médicaments par comparaison des
similarités/différences entre protéines cibles et
similarités/différences des ligands susceptibles de s'y fixer.
[1] Palczewski et al. Science 2000, 289, 739-745.
[2] Bissantz et al. J. Chem. Info. Comput. Sci. 2004, 44, 1162-1176.
[3] http://boinfo-pharma.u-strasbg.fr/gpcrdb/gpcrdb_form.html
[4] Tahtaoui et al. J. Biol. Chem. 2003, 278, 40010-40019.
[5] Petrel et al. J. Biol. Chem. 2003, 278, 49487-49494.
[6] Petrel et al. J. Biol. Chem. J. Biol. Chem. 2004, 279,
18990-18997
[7] Derick et al. Mol. Endocrinol. 2004, 18, 2777-2789
[8] Bissantz et al. Proteins 2003, 50, 5-25.
[9] Surgand et al., Proteins, soumis.
Contact :
Pascal Demange
SALLE FERNAND GALLAIS, Laboratoire de
Chimie de Coordination
205 route de Narbonne TOULOUSE CEDEX 4 |
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