SIG.b/InTheRes (ENVT-INRAE), Toulouse

Description :

En 2021, SIG.b a démarré une collaboration avec l’équipe E. Giraud d’InTheRes (ENVT-INRAE ​​Toulouse).

La ciprofloxacine est un antibiotique de la famille des fluoroquinolones (FQ) dont la cible principale est l’ADN gyrase. L’exposition répétée d’une souche sensible, Escherichia.coli ATCC25922, à la ciprofloxacine à des concentrations thérapeutiques a conduit à l’isolement de deux mutants tolérants. Le séquençage du génome (WGS) des mutants a révélé des mutations ponctuelles dans le gène gyrB, l’une des deux sous-unités de l’ADN gyrase.

Objectifs du service :

Reconstruction de souches par mutagenèse dirigée

– ATCC25922, la souche de référence pour les antibiogrammes utilisée dans cette étude présente une faible capacité à être transformée. Sa transformabilité a été améliorée.

– Nous avons réintroduit dans la souche parentale les mutations révélées par le séquençage, afin de vérifier que ces mutations ponctuelles sont bien responsables des phénotypes de résistance et de tolérance observés.

Financement :

La prestation forfaitaire et les consommables ont été financés par l’équipe INRAE. La doctorante de l’équipe INRAE ​​a été hébergée pendant 6 mois dans le service afin d’être formée à réaliser les expériences de biologie moléculaire et génétique.

Publication associée :

Front Microbiol. 2022; doi: 10.3389/fmicb.2022.908296. Perault A, Turlan C, Eynard N, Vallé Q, Bousquet-Melou A and Giraud E (2022). Repeated Exposure of Escherichia coli to High Ciprofloxacin Concentrations Selects gyrB Mutants That Show Fluoroquinolone-Specific Hyperpersistence.