Responsable d'équipe
Notre laboratoire étudie les interactions entre Mycobacterium tuberculosis et l’hôte afin d’identifier de nouvelles stratégies de prévention et de traitement de la tuberculose. Nous analysons les mécanismes de survie bactérienne, la reprogrammation des cellules immunitaires, dont les macrophages, les cellules dendritiques, les lymphocytes T et les cellules stromales, ainsi que la co-infection tuberculose/VIH-1, en nous appuyant sur des approches d’imagerie avancée et de multi-omique pour orienter le développement de thérapies ciblant l’hôte, de vaccins et de stratégies antimicrobiennes.
Nous étudions les interactions hôte-pathogène dans la tuberculose, avec un intérêt particulier pour l'immunité antituberculeuse et pour les liens qui unissent évolution, physiologie et virulence chez M. tuberculosis.
Notre laboratoire se consacre à l’étude des interactions complexes entre Mycobacterium tuberculosis (Mtb) et son hôte humain, avec pour objectif de développer de nouvelles approches thérapeutiques et d’améliorer la prise en charge de la maladie. Nous cherchons à comprendre comment Mtb survit et se développe au sein des macrophages et des granulomes pulmonaires, en identifiant les mécanismes qui soutiennent sa persistance en conditions de stress. Nos travaux ont mis en évidence le rôle clé des systèmes toxine-antitoxine, des pompes d’efflux des métaux et des voies d’acquisition des nutriments, notamment le métabolisme du sulfate et de la cystéine, dans la survie bactérienne, l’équilibre rédox et la virulence, constituant ainsi des cibles thérapeutiques prometteuses.
En parallèle, nous étudions la manière dont Mtb module l’immunité de l’hôte, en reprogrammant le métabolisme des macrophages, la fonction des cellules dendritiques et les réponses des lymphocytes T afin de favoriser sa persistance. Nos recherches ont identifié des voies et des molécules clés, telles que le récepteur immunitaire des cellules dendritiques (DCIR) et l’acide polysialique, qui régulent l’inflammation et le recrutement des monocytes. Par ailleurs, les cellules stromales, les cellules lymphoïdes innées, ainsi que la diversité des lymphocytes T CD4+ et CD8+, contribuent à l’immunité protectrice.
Nos travaux s’étendent également à la co-infection tuberculose/VIH-1, révélant comment Mtb favorise la réplication et la dissémination du VIH-1 via des macrophages reprogrammés, mettant en évidence de nouvelles pistes d’intervention chez les patients co-infectés.
Nos approches combinent imagerie avancée, technologies omiques et expertises collaboratives afin d’étudier ces processus à l’échelle cellulaire et des organes, avec l’ambition de traduire ces découvertes en approches thérapeutiques ciblant l’hôte, en vaccins améliorés et en nouvelles stratégies antimicrobiennes. En intégrant les connaissances sur la physiologie mycobactérienne et l’immunité de l’hôte, notre équipe vise à éclairer la biologie de la tuberculose et à accélérer le développement d’interventions innovantes pour lutter contre cette maladie.
Notre équipe de recherche réunit une communauté dynamique et diverse de scientifiques, comprenant doctorants, postdoctorants, chercheurs en début et en fin de carrière, ainsi que des collaborateurs en France et à l’international. Nous sommes attachés à promouvoir un environnement ouvert, inclusif et bienveillant, valorisant la diversité des parcours, des perspectives, des disciplines et des trajectoires professionnelles.
Nos chercheurs évoluent ensuite avec succès dans des laboratoires et institutions de premier plan, tant dans le secteur public que privé, en France et à l’international, ce qui reflète l’exigence de notre formation, la qualité de notre encadrement et la diversité des opportunités que nous offrons pour leur carrière.
Ensemble, nous faisons progresser les connaissances fondamentales tout en formant la prochaine génération de scientifiques, afin de relever les défis posés par la tuberculose à travers des approches multidisciplinaires, collaboratives et ouvertes sur le monde.
Pierre Dupuy (CR, CNRS)
Claude Gutierrez (PR-Émérite, UPS)
Denis Hudrisier (PR CE, UPS)
Geanncarlo Lugo (DR2, CNRS)
Fabien Létisse (PR, UPS)
Olivier Neyrolles (DR CE, CNRS)
Yannick Poquet (MCU HC, UPS)
Yoann Rombouts (CR, CNRS)
Philippe Vogeleer (MCU, UPS)
Annie Behar
Florence Levillain (IE HC, CNRS)
Elizabeth Bautista
Saurabh Chugh
Tejan Lodhiya
Louis Benastre
Maxime Caouaille
Clara Deyts
Maxime Kaiser
Maxime Pingret
Stella Rousset
Dupuy et al. (2026) Membrane-associated effluxosomes coordinate multi-metal resistance in Mycobacterium tuberculosis. EMBO J
Le Mouëllic et al. (2025) Inorganic sulfate is critical for Mycobacterium tuberculosis lung tissue colonization and redox balance. PNAS
Boudehen*, Faucher* et al. (2022) Mycobacterial resistance to zinc poisoning requires assembly of P-ATPase-containing membrane metal efflux platforms. Nat Commun
Corral et al. (2022) ILC precursors differentiate into metabolically distinct ILC1-like cells during Mycobacterium tuberculosis infection. Cell Rep
Souriant et al. (2019) Tuberculosis exacerbates HIV-1 infection through IL-10/STAT3-dependent tunneling nanotube formation in macrophages. Cell Rep
Freire*, Gutierrez* et al. (2019) An NAD+ phosphorylase toxin triggers Mycobacterium tuberculosis cell death. Mol Cell
Avril 2026 – Olivier Neyrolles est élu à l’Académie Européenne de Microbiologie
Juin 2024 – Wendy Le Mouëllic est la lauréate nationale du concours Ma Thèse en 180 secondes (MT180). En savoir plus…
Octobre 2021 – Olivier Neyrolles reçoit la Médaille d’argent du CNRS. En savoir plus…
Novembre 2020 – Olivier Neyrolles reçoit le Prix Jacques Piraud de la Fondation pour la Recherche Médicale (FRM).
Octobre 2018 – Le Prix PEPS 2018 pour l’innovation pédagogique est attribué au projet IMMUNOVA (Apprentissage actif, interactif et flexible en immunologie) dirigé par Denis Hudrisier.
Le projet IMMUNOVA repose sur deux axes :
un usage intensif des ressources numériques, permettant aux étudiants de se préparer avant et après les séances en présentiel (également accessibles en ligne), favorisant ainsi la flexibilité et l’autonomie dans l’apprentissage, notamment pour ceux ne pouvant assister aux cours selon les horaires établis ;
la réalisation de projets en équipe en immunologie, selon différentes approches (production de ressources numériques, entretiens avec des chercheurs, impression 3D de protéines dans des FabLabs, conception de serious games).
En savoir plus…
Décembre 2017 – Anthony Troegeler reçoit le Prix Bretesche de médecine décerné par l’Académie des sciences, inscriptions et belles-lettres de Toulouse.
Anthony a réalisé sa thèse au sein de notre laboratoire, où il a étudié le rôle du récepteur immunitaire inné DCIR dans l’immunité contre la tuberculose. Ses travaux ont été publiés en janvier 2017 dans Proc Natl Acad Sci USA. Il a reçu le prix le 3 décembre à l’Hôtel d’Assézat, Toulouse.
Juin 2017 – Yoann Rombouts reçoit le IGO Young Glycoscientist Award 2017.
Décembre 2016 – Olivier Neyrolles reçoit le Prix national Sanofi–Institut Pasteur dans le domaine des maladies tropicales négligées, pour ses travaux sur la tuberculose, lors d’une cérémonie à l’Institut Pasteur, Paris.
Olivier et son équipe ont contribué à la compréhension de plusieurs aspects des interactions complexes entre le bacille de la tuberculose (Mycobacterium tuberculosis) et son hôte, notamment l’immunité antimycobactérienne, l’évolution, la physiologie et la virulence de la bactérie.
Décembre 2014 – Alexandre Gouzy reçoit le Prix Sanofi de l’Académie des sciences de Toulouse.
Février 2014 – Olivier Neyrolles reçoit le Prix « Coup d’élan pour la recherche française » de la Fondation Bettencourt Schueller, lors d’une cérémonie à l’Institut de France, Paris, au cours de laquelle Madame F. Bettencourt Meyers a remis le prix.
Ce prix récompense des équipes sélectionnées pour le caractère prometteur de leurs programmes de recherche. Il distingue à la fois la qualité des travaux de l’équipe d’Olivier Neyrolles et celle des recherches menées au sein du département Tuberculosis & Infection Biology de l’IPBS dans les domaines du développement de vaccins et d’antibiotiques.
Avril 2012 – Hélène Botella est lauréate du Prix AXA–Académie des sciences pour ses travaux sur le rôle du zinc comme mécanisme naturel de défense contre les infections.
2009 – Olivier Neyrolles reçoit la Médaille de bronze du CNRS.
How the tuberculosis bacillus takes advantage of the lipids of its host
Siglec-1: Bridging the synergy between Mycobacterium tuberculosis and HIV-1
How the tuberculosis bacillus learned to respire in the absence of oxygen
A new target to fight tuberculosis: a population of immune cells favourable to the resilience of the bacillus… Press release in french
We are proud to highlight the unique and long-standing collaboration between our lab and the Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida (INBIRS), led by Dr. Luciana Balboa, within the France–Argentina MAC-TB/HIV partnership. Launched in 2014 under the ECOS Sud program and formalized in 2016 as a Laboratoire International Associé (LIA) between IPBS and INBIRS, the LIA was coordinated by Olivier Neyrolles and Luciana Balboa. In 2021, the collaboration was renewed as a CNRS International Research Project (IRP), coordinated by Geanncarlo Lugo and Luciana Balboa. For over a decade, our teams have combined complementary expertise in TB immunometabolism and HIV biology to decipher how the tuberculous microenvironment reshapes macrophage lipid networks and metabolism, turning them into “Trojan horses” that facilitate HIV-1 persistence and dissemination. This highly productive partnership has generated major joint publications, trained numerous PhD students and postdoctoral fellows through sustained bilateral exchanges, and significantly increased the international visibility of our work on TB/HIV co-infection. The closing meeting held at IPBS on January 16, 2026, celebrated ten years of scientific achievements while reaffirming our shared commitment to deepen and expand this strategic Franco-Argentine collaboration in the years ahead.
Our team was officially labelled by the Fondation pour la Recherche Médicale (2016-2019 and 2021-2024).
The complete list of our publications is available through Pubmed.
Bettencourt, P.J.G., Joosten, S.A., Lindestam Arlehamn, C.S., Behr, M.A., Locht, C., Neyrolles, O. (2021) 100 years of the Bacillus Calmette-Guerin vaccine. Vaccine 39, 7221-7222 (View)
Levillain, F.*, Kim, H.*, Woong Kwon, K., Clark, S., Cia, F., Malaga, W., Lanni, F., Brodin, P., Gicquel, B., Guilhot, C., Bancroft, G.J., Williams, A., Jae Shin, S., Poquet, Y.**, Neyrolles, O.** (2020) Preclinical assessment of a new live attenuated Mycobacterium tuberculosis Beijing-based vaccine for tuberculosis. Vaccine 38, 1416-1423 (View)
Voss, G., Casimiro, D., Neyrolles, O., Williams, A., Kaufmann, S.H.E., McShane, H., Hatherill, M., Fletcher, H.A. (2018) Progress and challenges in TB vaccine development. F1000Res 7, 199 (View)
Kaufmann, S.H.E., Dockrell, H.M., Drager, N., Ho, M.M., McShane, H., Neyrolles, O., Ottenhoff, T.H.M., Patel, B., Roordink, D., Spertini, F., Stenger, S., Thole, J., Verreck, F.A.W., Williams, A., Consortium, T. (2017) TBVAC2020: Advancing Tuberculosis Vaccines from Discovery to Clinical Development. Front Immunol 8, 1203 (View)
Scriba, T.J., Kaufmann, S.H., Henri Lambert, P., Sanicas, M., Martin, C., Neyrolles, O. (2016) Vaccination Against Tuberculosis With Whole-Cell Mycobacterial Vaccines. J Infect Dis 214, 659-664 (View)
Dupuy, P., Monard, S.C., Neyrolles, O., Lugo-Villarino, G. (2025) From Phagosomes to Niches: Macrophage Biology in Tuberculosis Revisited. Cold Spring Harb Perspect Med
Lefrançais, E., Hudrisier, D., Neyrolles, O., Behar, S.M., Ernst, J.D. (2025) Finding and filling the knowledge gaps in mechanisms of T cell-mediated TB immunity to inform vaccine design. Nat Rev Immunol (View)
Bénard, A., Balboa, L., Caouaille, M., Ravon-Katossky, L., Meunier, E., Fillatreau, S., Sasiain, M.D.C., Neyrolles, O., Hudrisier, D. (2025) Human IL-6-Producing B Cells Promote the Differentiation of Monocytes Toward an Anti-Inflammatory CD16⁺CD163⁺CD206⁺PD-L1⁺ Phenotype in Tuberculosis. Eur J Immunol
Maio, M., Joly, M., Vahlas, Z., Barros, J., Marín Franco, J.L., Genoula, M., Monard, S., Vecchione, M.B., Fuentes, F., Gonzalez Polo, V., Quiroga, M.F., Vermeulen, M., Argüello, R.J., Inwentarz, S., Musella, R., Ciallella, L., González Montaner, P., Palmero, D., Lugo Villarino, G., Sasiain, M.C., Neyrolles O., Verollet, C., Balboa, L. (2023) Elevated glycolytic metabolism of monocytes limits the generation of HIF-1α-driven migratory dendritic cells in tuberculosis. Elife (View)
Corral, D., Charton, A., Krauss, M.Z., Blanquart, E., Levillain, F., Lefrancais, E., Sneperger, T., Vahlas, Z., Girard, J.P., Eberl, G., Poquet, Y., Guery, J.C., Arguello, R.J., Belkaid, Y., Mayer-Barber, K.D., Hepworth, M.R., Neyrolles, O.**, Hudrisier, D.** (2022) ILC precursors differentiate into metabolically distinct ILC1-like cells during Mycobacterium tuberculosis infection. Cell Rep 39, 110715 (View)
Bernard-Raichon, L., Colom, A., Monard, S.C., Namouchi, A., Cescato, M., Garnier, H., Leon-Icaza, S.A., Metais, A., Dumas, A., Corral, D., Ghebrendrias, N., Guilloton, P., Verollet, C., Hudrisier, D., Remot, A., Langella, P., Thomas, M., Cougoule, C.**, Neyrolles, O.**, Lugo-Villarino, G**. (2021) A Pulmonary Lactobacillus murinus Strain Induces Th17 and RORgammat(+) Regulatory T Cells and Reduces Lung Inflammation in Tuberculosis. J Immunol 207, 1857-1870 (View)
Marin Franco, J.L., Genoula, M., Corral, D., Duette, G., Ferreyra, M., Maio, M., Dolotowicz, M.B., Aparicio-Trejo, O.E., Patino-Martinez, E., Charton, A., Metais, A., Fuentes, F., Soldan, V., Morana, E.J., Palmero, D., Ostrowski, M., Schierloh, P., Sanchez-Torres, C., Hernandez-Pando, R., Pedraza-Chaverri, J., Rombouts, Y., Hudrisier, D., Layre, E., Verollet, C., Maridonneau-Parini, I., Neyrolles, O., Sasiain, M.D.C., Lugo-Villarino, G., Balboa, L. (2020) Host-Derived Lipids from Tuberculous Pleurisy Impair Macrophage Microbicidal-Associated Metabolic Activity. Cell Rep 33, 108547 (View)
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Souriant, S., Balboa, L., Dupont, M., Pingris, K., Kviatcovsky, D., Cougoule, C., Lastrucci, C., Bah, A., Gasser, R., Poincloux, R., Raynaud-Messina, B., Al Saati, T., Inwentarz, S., Poggi, S., Morana, E.J., Gonzalez-Montaner, P., Corti, M., Lagane, B., Vergne, I., Allers, C., Kaushal, D., Kuroda, M.J., Sasiain, M.D.C., Neyrolles, O.**, Maridonneau-Parini, I.**, Lugo-Villarino, G.**, Verollet, C**. (2019) Tuberculosis Exacerbates HIV-1 Infection through IL-10/STAT3-Dependent Tunneling Nanotube Formation in Macrophages. Cell Rep 26, 3586-3599 e3587 (View) | This article was highlighted in Science
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Troegeler, A., Mercier, I., Cougoule, C., Pietretti, D., Colom, A., Duval, C., Vu Manh, T.P., Capilla, F., Poincloux, R., Pingris, K., Nigou, J., Rademann, J., Dalod, M., Verreck, F.A., Al Saati, T., Lugo-Villarino, G., Lepenies, B., Hudrisier, D., Neyrolles, O. (2017) C-type lectin receptor DCIR modulates immunity to tuberculosis by sustaining type I interferon signaling in dendritic cells. Proc Natl Acad Sci USA 114, E540-E549 (View)
Lastrucci, C., Benard, A., Balboa, L., Pingris, K., Souriant, S., Poincloux, R., Al Saati, T., Rasolofo, V., Gonzalez-Montaner, P., Inwentarz, S., Morana, E.J., Kondova, I., Verreck, F.A., Sasiain Mdel, C., Neyrolles, O.**, Maridonneau-Parini, I.**, Lugo-Villarino, G.**, Cougoule, C.** (2015) Tuberculosis is associated with expansion of a motile, permissive and immunomodulatory CD16(+) monocyte population via the IL-10/STAT3 axis. Cell Res 25, 1333-1351 (View)
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We are extremely proud of our former research assistants, PhD students and post-doctoral fellows who are now continuing their career in the best labs, enterprises and institutions in life sciences!
