SIG – Développement interne (2021)

Le LMGM a fait l’acquisition de la collection ASKA d’Escherichia coli (clones individuels en format microplaque) dans laquelle chacune des 4123 ORF chromosomiques prédites de la souche Escherichia coli W3110 a été insérée dans un plasmide sous le contrôle d’un promoteur inductible, plasmides ensuite établis dans la souche E. coli AG1.

Afin de réaliser des expériences de sélection de suppresseurs multicopies, nous avons extrait les plasmides à partir de l’ensemble de ces souches. Nous avons validé la représentativité de la librairie plasmidique ainsi réalisée de deux manières : d’une part en réalisant des tests de complémentation sur 5 mutants de délétion auxotrophes ; d’autre part en séquençant directement l’intégralité de l’ADN plasmidique (Nanopore, prestation externalisée).

Objectifs :

Nous utilisons cette librairie plasmidique dans le cadre de nos projets collaboratifs visant à identifier les suppresseurs multicopies de phénotypes particuliers.