Plateforme Intégrée de Criblage de Toulouse (PICT)

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Virginie Nahoum

Responsable de la plateforme

PICT est une plateforme multidisciplinaire qui vise à fournir à la communauté scientifique et médicale un ensemble complet de technologies et d’expertise permettant l’identification aléatoire ou basée sur la structure et la conception rationnelle d’inhibiteurs de cibles thérapeutiques, ou d’effecteurs de toute autre cible, la découverte de nouvelles enzymes et la caractérisation de leurs interactions.

PICT fournit un ensemble complet de technologies et d'expertise pour le criblage et la conception rationnelle de ligands de n'importe quelle cible et pour l'ingénierie enzymatique.

PICT associe le savoir-faire et l’expertise de trois laboratoires situés à Toulouse : L’IPBS (Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale : biophysique, biologie structurale et bio-informatique), qui est le site coordinateur, le SPCMIB (laboratoire de Synthèse et Physico-Chimie des Molécules d’Intérêt Biologique : chimie médicinale) et le TBI (Toulouse Biotechnology Institute : découverte et optimisation d’enzymes). Ces établissements mènent des recherches de pointe dans leurs domaines respectifs et mettent leur savoir-faire technologique, leurs équipements et leur personnel à la disposition de la plateforme.

Offre scientifique

PICT fournit à ses utilisateurs l’accès aux outils et à l’expertise scientifique nécessaires à la détermination des structures macromoléculaires, au criblage et à la mesure des interactions par des méthodes biophysiques, à la synthèse chimique pour le développement de bibliothèques de composés ciblés et à l’optimisation de ligands « hit-to-lead ». PICT assure également l’analyse, la purification et l’identification de diverses familles de molécules et de protéines de faible poids moléculaire, l’ingénierie des protéines, l’évolution dirigée et le criblage à haut débit d’enzymes optimisées, et enfin, la métagénomique fonctionnelle pour la découverte de nouvelles enzymes.

Equipements

Le site de l’IPBS se concentre sur la synthèse peptidique, l’identification de ligands par des approches de criblage biophysique et la caractérisation biophysique de protéines et de complexes protéine-ligands (diffusion statique et dynamique de la lumière, titration calorimétrique isotherme, fluorimétrie différentielle à balayage (DSF) et Nano-DSF, thermophorèse à micro-échelle, décalage spectral). PICT propose également des prestations de RMN (500 MHz, 600 MHz cryosonde et 700 MHz), de cristallographie aux rayons X (robots de cristallisation et de visualisation) et de bio-informatique (clusters 224 et 40 cœurs). Une librairie propre de fragments (environ 1000 composés) a été développée pour les projets de conception d’inhibiteurs basés sur les fragments, et la plateforme offre également un accès à des librairies de composés “drug-like” (>11000) et de peptides (>20000).

Activité

PICT fait partie du réseau régional GenoToul et a reçu le label national IBiSA. La plateforme est certifiée ISO-9001 depuis 2012 et NFX50-900 depuis 2015. Cette certification atteste de la qualité des services offerts, en mettant l’accent sur la maîtrise des processus, la responsabilité, la traçabilité et la satisfaction des clients. PICT est ouvert aux laboratoires académiques ainsi qu’aux entreprises privées, tant au niveau local que national. Différents types de services sont proposés, allant de l’accès à des équipements spécialisés à une prestation de services complète, dans le cadre de contrats de collaboration et de partenariats industriels.

Équipe

Chercheurs

Andrew Atkinson (CNRS)
Laurent Maveyraud (University)
Lionel Mourey (CNRS)
Olivier Saurel (CNRS)

Ingénieurs

Nathalie Doncescu (CNRS)
Valérie Guillet (CNRS)
Virginie Nahoum (CNRS)
Pascal Ramos (University)

Batista et al. (2023) The Conserved yeast protein Knr4 involved in cell wall integrity is a multi-domain intrinsically disordered protein. J Mol Bio

Chebaiki et al. (2023) Discovery of new diaryl ether inhibitors against Mycobacterium tuberculosis targeting the minor portal of InhA. Eur J Med Chem

Ferré et al. (2023) Sodium is a negative allosteric regulator of the ghrelin receptor. Cell Rep

Bon et al. (2022) Solution structure of the type I polyketide synthase Pks13 from Mycobacterium tuberculosis. BMC Biol

Boudehen et al. (2022) Mycobacterial resistance to zinc poisoning requires assembly of P-ATPase-containing membrane metal efflux platforms. Nat Commun

Le et al. (2022) Drug screening approach against mycobacterial fatty acyl-AMP ligase FAAL32 renews the interest of the salicylanilide pharmacophore in the fight against tuberculosis. Bioorg Med Chem

Mansour et al. (2022) Substrate recognition and cryo-EM structure of the ribosome-bound TAC toxin of Mycobacterium tuberculosis. Nat Commun

Tournier et al. (2020) An engineered PET depolymerase to break down and recycle plastic bottles. Nature

Structure cristalline d’une méthyltransférase (HMA ou MMA4) de M. tuberculosis en complexe avec le S-adénosyl-N-décyl-aminoéthyle (SADAE) ©Olivier Saurel

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