ProteoToul Services : Plateforme protéomique de Toulouse

Odile Schiltz
Odile Schiltz

Responsable

S’appuyant sur son expertise dans le domaine de la spectrométrie de masse (MS) et de la protéomique et utilisant une instrumentation en MS et des outils bioinformatiques à la pointe du domaine, ProteoToul Services propose des analyses de qualité en protéomique et MS structurale aux communautés scientifiques académique et industrielle. La plateforme peut prendre en charge des projets dans divers domaines, allant de la biologie et de la santé aux agrobiosciences.

Notre solide expertise en spectrométrie de masse et en protéomique nous permet de mettre en oeuvre de multiples stratégies pour identifier et quantifier des protéomes complexes et pour caractériser des protéines.

ProteoToul Services est une plateforme de haut niveau en protéomique et en spectrométrie de masse structurale. Avec ProteoToul Recherche, l’équipe de recherche de l’IPBS en protéomique et spectrométrie de masse des biomolécules, elles forment ProteoToul (proteotoul.ipbs.fr). ProteoToul est l’un des trois sites constituant l’infrastructure protéomique française (ProFI), qui a été créée en 2012 avec deux autres groupes de protéomique à Grenoble et à Strasbourg pour augmenter les capacités de recherche et la compétitivité. ProteoToul fait également partie de réseaux régionaux (GenoToul) et nationaux (IBiSA) de plateformes en sciences du vivant et en agronomie.

Offre scientifique

L’offre de services est régulièrement enrichie avec de nouvelles méthodologies développées grâce au travail intégré et à l’expertise partagée de ProteoToul Services avec ProteoToul Recherche. ProteoToul Services propose plusieurs types d’analyses qui couvrent tous les aspects de la protéomique, de l’identification des protéines à l’analyse quantitative différentielle à grande échelle de protéomes complexes. L’analyse de modifications post-traductionnelles sur une seule protéine ou à l’échelle globale peut être réalisée ainsi que l’identification et la quantification de partenaires protéiques. Des analyses protéomiques ciblées peuvent également être mises en œuvre pour la validation et la quantification de protéines d’intérêt particulier. Des approches complémentaires de spectrométrie de masse structurale sont disponibles pour la caractérisation de protéines intactes et l’analyse de complexes protéiques. Un large éventail de domaines d’application est couvert (par exemple, la biologie animale et végétale, la santé, la microbiologie).

Équipement

La protéomique basée sur la MS est un domaine qui évolue rapidement. ProteoToul Services est équipé des dernières générations de spectromètres de masse couplés à des systèmes chromatographiques (nanoLC-MS/MS) pour l’acquisition des données et d’outils bioinformatiques dédiés pour l’analyse des données.

Activité

ProteoToul Services travaille avec des laboratoires académiques et des entreprises privées. En fonction de l’objectif des projets, ceux-ci sont traités sous forme de prestations pour des analyses individuelles ou sous forme de projet de recherche financé en collaboration. Un contrat de service ou de recherche peut également être établi avec des partenaires industriels. ProteoToul Services possède un système de management de la qualité et est certifié ISO 9001 depuis 2006 et NFX 50-900 depuis 2014.

Équipe

Chercheurs

Anne Gonzalez de Peredo (CR HC, CNRS)
Julien Marcoux (CR, CNRS)
Odile Schiltz (DR1, CNRS)

Ingénieurs

Renaud Albigot (IE, CNRS)
David Bouyssié (IR, CNRS)
Carine Froment (IR, CNRS)
Marie Locard-Paulet (IR, CNRS)
Marlène Marcellin (IE, CNRS)
Emmanuelle Mouton (IE HC, UPS)
Carole Pichereaux (IE, CNRS)
Clément Robin
Alexandre Stella (IE HC, CNRS)

Mosquera-Restrepo et al. (2022) Mycobacterium tuberculosis fingerprint in human breath allows tuberculosis detection. Nat Commun

Godet et al. (2022) Long non-coding RNA Neat1 and paraspeckle components are translational regulators in hypoxia. Elife

Colombat et al. (2022) Mass-spectrometry-based proteomics amyloid typing in clinical practice: state-of-the-art from a French nationwide cohort. Haematologica

Froment et al. (2020) Analysis of 5000 year-old human teeth using optimized large-scale and targeted proteomics approaches for detection of sex-specific peptides. J Proteomics

Imbert et al. (2020) Resistance of melanoma to immune checkpoint inhibitors is overcome by targeting the sphingosine kinase-1. Nat Commun

Pechalrieu et al. (2020) Bisubstrate-type chemical probes identify GRP94 as a potential target of cytosine-containing adenosine analogs. ACS Chem Biol

Pichereaux et al. (2019) Analysis of durum wheat proteome changes under marine and fungal biostimulant treatments using large-scale quantitative proteomics: A useful dataset of durum wheat proteins. J Proteomics

Aniort et al. (2019) Muscle wasting in patients with end-stage renal disease or early-stage lung cancer: common mechanisms at work. J Cachexia Sarcopenia Muscle

Équipement de pointe en spectrométrie de masse permettant des analyses à haute résolution et à grande vitesse d’acquisition. © R Albigot.

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